Métagénomique
Les laboratoires du groupe SPIRAL réalisent pour vous un ensemble d’analyses de biologie moléculaire basées sur des technologies complémentaires pour l’identification et la quantification de matériel génétique présent dans vos échantillons. La Métagénomique est la technique de choix pour une investigation complète du matériel génétique présent.
Métagénomique - Communauté microbienne d’un échantillon
La métagénomique est une technologie innovante (séquençage haut-débit, bio-informatique…) qui permet en particulier d’explorer la diversité microbienne dans des environnements complexes (aliments, prélèvements biologiques, plantes…) via le séquençage direct de l’ADN ou de l’ARN.
Applications de la technologie métagénomique en microbiologie
Nous pouvons réaliser, avec l’aide de nos partenaires, des analyses métagénomiques pour l’exploration de la composition taxonomique d’une communauté microbienne dans des matrices variées et ainsi caractériser une communauté microbienne (identification et abondance).
Cette exploration de la flore microbienne repose sur le séquençage d’un unique gène au lieu d’un génome complet (on parlerait alors de métagénomique globale ou shotgun sequencing). Le gène utilisé est celui de l’ARN 16S, présent uniquement chez les bactéries, tout en présentant des régions suffisamment variables pour pouvoir discriminer une espèce.
L’analyse métagénomique permet de caractériser le microbiome chez l’homme et l’animal (tractus digestif, voies respiratoires, peau) et de mettre en évidence les éventuels déséquilibres (étude d’effets pré ou probiotiques, effets d’un cosmétique…). C’est une technique particulièrement bien adaptée au diagnostic clinique, en particulier en cancérologie, gastroentérologie, dermatologie, urologie ou pneumologie.
L’analyse métagénomique permet aussi de détecter les microorganismes pouvant être impliqués dans l’altération d’un aliment : identification de germes indésirables, distinction entre bactéries mortes et vivantes dans des aliments thermiquement traités, suivi de processus de fermentation…
Dans le domaine de l’environnement, l’analyse métagénomique permet d’explorer les communautés microbiennes d’eaux, des sols, de végétaux…(études de pollutions, analyse es l’équilibre des écosystèmes). C’est par exemple un outil prometteur pour évaluer la santé de l’écosystème des sols (bactéries, champignons, protistes… ).
Une mutualisation des compétence
Pour la réalisation de ces analyses, les Laboratoires de Recherches Appliquées Spiral ont établi des partenariats avec des équipes de recherche universitaires et des start-up en biologie moléculaire.
Téléchargez la brochure : Lara Spiral – Labo Biologie moléculaire 2018
Nous réalisons aussi pour nos clients d’autres analyses biochimiques et biologiques, comme par exemple des dosages immunologiques ou des mesures d’activités biologiques (antioxydantes, anti-inflammatoires…)
Notre équipe se tient à votre disposition pour vous conseiller dans le choix des analyses les plus pertinentes à réaliser pour répondre à vos besoins. N’hésitez pas à nous contacter !